明珠湖原是长江南支的一条支流，人工筑堤围造而成。公园水面积为3000亩，湖面南北长3500多米，东西宽500-700米，最深处负7-8米，湖中水容量达500万立方米，是崇明最大的天然淡水湖泊。湖水清澈，无污染，无公害，经检测水质为国家二级。
如此优良的水质，孕育了许多鱼类资源。目前湖内有青鱼、花鲢鱼、鲫鱼、鳜鱼等等不下20种，肉鲜味美。园内还设有鱼标本馆，陈列多种鱼类，包括2007年捕捞上来的一条“乌青王”，1.62米的身长，150斤的体重，和47岁的年龄，使其成为了“镇馆之宝”。
正因如此，明珠湖鱼成为继千岛湖有机鱼后的第二个中国有机鱼品牌。每年10月，公园举办“明珠湖鱼鲜节”，明珠湖大鱼头汤、明珠湖鱼鲜宴和有机鱼火锅等鱼菜，成为游客交口称赞的湖鲜盛宴。
