1、遗传因素
不同品种玉米多穗现象发生程度不一.主要是不同品种的腋芽发育进程不一样造成的。有的品种在适宜条件下多个腋芽均同步分化发育易形成多穗.有的品种则先进腋芽分化发育优势明显，从而抑制下一节果穗发育进程，不形成多穗。
2、顶端雄花序生长受抑制
促进雌穗发育在很多植物中.水分亏缺引起的最快和最显着的代谢效应之一是激素脱落酸的积累.这种反应也出现在玉米植株中.玉米的雄穗是由顶端雄花序发育而成，生长势较强.而雌穗是由腋芽发育而成，发育相对比雄穗较迟，生长势较弱。在玉米发育正常状态中，于第6或第7节上产生一个单个成熟的雌性花序.又叫雌穗，这个过程中如遇外界条件不适宜.如在顶端雄性花序形成时遭受短期的水分亏缺.则引起57节上发育成2～3个成熟的雌性花序.导致多穗的发生。
3、碳、氮代谢不协调
拔节后玉米进入营养生长和生殖生长旺盛期，茎叶生长量大，雌雄穗分化形成，干物质积累迅速增加.此时如果土壤肥沃，水肥过多，会造成碳、氮代谢不协调，影响糖类等矿物质向果穗运输与积累.过多的营养物质会促使多个雌穗花序发育成熟而形成多穗
4、不合理的种植方式
不同的品种.种植密度要求不一，密度过大.叶片相互遮阴，花粉不易落到雌穗上，无法正常受精结实.加之适宜的环境条件，促使下一雌穗发育成熟，从而形成多穗。
5、环境条件不适宜
在抽雄开花期.玉米生长发育正常情况下.如果遇到寡照阴雨天气.雄穗不散粉或即使散粉但由于雌穗花丝有雨水而导致花粉粒吸水膨胀破裂死亡.影响受精，直接导致空穗无子，这样营养物质过剩又重新分配到下一节果穗.从而导致多穗发生。
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