近年来，随着兽药、抗生素、饲料添加剂等使用量的不断增加，畜牧业的可持续发展面临着严峻挑战。重产量、重利益的观念，使畜禽产品生产者对发展有机畜禽产业缺乏必要的认识，积极性难以提升。而生产投入品的厂家往往从利益出发，不愿放弃已有的市场，使得自身的转型升级受阻。产业管理和标准化建设环节主动性不足，对有机畜禽产业发展的监管和推动薄弱。可见，发展有机畜禽产业，是一个系统工程，需多方发力。
加强有机畜禽产业发展的宣传。采取各种宣传渠道，将有机畜禽产业发展的标准和政策贯彻到畜禽产品生产的全过程，唤起畜禽产品生产环节的商家对有机畜禽产业发展的责任意识，提高他们发展有机畜禽产业的自觉性。
加大有机畜禽产业发展的补贴力度。有机畜禽产业是劳动密集型和知识密集型产业，效益相对低下。政府要通过产业规划来加强引导，通过市场手段来保证供给，通过政策性补贴和支持来提升有机畜禽产品生产者的效益。
加快有机畜禽产品的科技开发。要加强对品种的保护和研发，培育有机畜禽产品品牌。加快现代农业装备技术条件下的有机畜禽产品生产方式，将现代畜牧业与传统畜牧业结合，在确保畜禽产品质量的前提下，提高有机畜禽产业发展效率。
