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鳖的敌害主要有老鼠、蛇类、鸟类、蚂蚁、蚊子等，主要危害鳖卵及1龄以下的稚、幼鳖，1龄以上体质健壮的鳖危害甚少。其中老鼠对鳖卵危害最大。
夜深人静是鳖产卵之良辰，老鼠也会趁此出洞，频繁活动于产卵场所，一方面干扰鳖正常产卵，另一方面老鼠在沙床上到处挖穴，引起鳖卵震动而导致胚胎死亡。
稚、幼鳖也容易被老鼠围攻和捕食，一些体质差、反应较迟钝的成鳖，在伏岸休息时，也常是老鼠袭击的目标。老鼠食鳖时，首先咬住鳖的颈部，继而将喉管咬断，掏出内脏吸取鲜血，取食鳖肉，然后逃之夭夭。
一旦遭鼠害，如不及时采取措施，一个晚上少则咬死3～4只鳖，多则几十只，尤其对稚、幼鳖危害更大。其次是蛇类，因其会挖掘泥沙，吞食鳖卵及刚孵化脱壳的稚鳖，危害甚大。
鸬鹚、翠鸟等鸟类，主要捕食稚鳖，有的鸟类还可携带病原体，从而传播疾病。所以在养鳖过程中，要加强这些敌害的防治，其防治方法如下：
1、鳖卵孵化室壁和稚鳖池较好用水泥砖结构，不留洞穴，堵塞鼠、蛇过往通道和藏身之所；
2、孵化室周围建造防蚁沟，沟深宽约10厘米，沟内注水，防止蚂蚁进入室内；
3、产卵场、孵化场及稚鳖池周围，经常用药饵毒杀老鼠、蛇，或设置诱捕器捕捉；
4、经常用药喷杀蚊子；
5、鸟类可张网防止，也可用弹弓等工具驱赶。
