好的苗种是水产养殖成功的基础，金鲳鱼养殖也不例外。如果能买到健康强壮的金鲳鱼苗，意味着鱼抢食快，抗病力强，病害少，成活率高，长速更快，效益好；反之，如果买到不好的鱼苗，很多时候会出现鱼不抢料，增重缓慢，且鱼苗的抗病力弱，环境变化时鱼更易得病，最后导致成活率较差，影响最后的效益。
选择健康苗种时，应遵循以下标准：规格均匀整齐，体表干净黏液少，色泽明亮，无损伤，在水下做集群逆水或绕圈游泳，抢食快速。养殖户要想选到好的金鲳鱼苗可以到苗场现场观察比较，如果看到鱼苗逆水转圈游泳、抢料迅速、受惊吓反应快速的则是好苗。
鱼苗投放时间应选择在没有大的寒潮南下，在小流水期，风浪小的晴天早晚放苗，苗期放养密度为50尾~80尾/立方米。放苗地点选择在鱼排中流水较缓的区域，避免流水对鱼苗的不利影响。
