黄花菜十分喜肥、耐肥，尤其对氮、磷、钾的需要量较多。在黄花菜抽蕾开花期间，必须每15-20天根部施一次肥，以氮磷钾完全肥为主，适当补充磷钾肥和有机肥，一般每次每亩施氮磷钾（15-15-15）硫酸钾或硝硫基或纯硫基复合肥15-20公斤、生物有机肥25-30公斤、磷酸二氢钾5-10公斤，把所有的肥料充分搅拌混合均匀后，均匀撒施在株行的空隙地上、再培上一层厚约8-10厘米的泥土，把肥料全部覆盖住即可。也可以每亩施氮磷钾（20-20-20）水溶肥8-10公斤、磷酸二氢钾4-5公斤、氨基酸水溶肥或腐殖酸水溶肥2-3公斤，对清水或沼液或沤制腐熟的人畜粪水500-600倍后，均匀淋施在黄花菜植株根部周围的土壤中，以肥液完全渗透入泥土中不外流为宜。
另外，在根部施肥的基础上，还要进行根外追肥，从叶面补充各种养分。在黄花菜抽蕾开花期间，必须每7-10天叶面喷洒一次0.1%硫酸镁、0.2%尿素、0.3%磷酸二氢钾、600倍氨基酸活性液肥混合液，连续喷洒5-6次，均匀喷湿所有的叶片、花蕾和花朵，以开始滴水为宜。
